شاید صرف فعالیت تجاری و موقعیت ترانزیتی زمینه ای برای حضور صاحبان افکار و ادیان مختلف را فراهم آورد که در این مورد و با استناد به آنچه گفته شد، شهر بم شاخص بوده است. مذهب اهالی شهر پس از فتح بم و اسلام آوردن آنان ، سنی با اکثریت شافعی بوده.با ظهور خوارج در تاریخ اسلام و حرکت آنها به جنوب شرقی ایران و کرانه های خلیج فارس ، بم نیز از مراکز خوارج ایران بشمار آمد.حضور و آوازه خوارج بم در گزارشهای بر جای مانده قابل توجه است و همگی از مسجد و دارائی آنها در این شهر یاد می کنند. زرتشتیان نیز از جمله اقلیتهای دینی بم بوده اند. نزدیکی بم به قهستان، حوزه فعالیت اسماعیلیه و قرار گرفتن آن بر سر راه هندوستان بعنوان آخرین مرکز باطنیان، زمینه نفوذ اهل این فرقه در بم را بوجود آورده است.
آقا خان محلاتی شورش خود علیه پادشاهان را در بم اعلام کرد.از سوی دیگر بم بویژه از سده ها ی هشتم و نهم هجری به این سوی، سرزمین و خاستگاه صوفیان و عرفای نامی بوده است .کسانی چون سید طاهرالدین بمی صاحب بم نامه میرزا نعیم و رونق علی شاه و همچنین وجود آثاری چون خانقاه بم و کتابی مانند رساله مقامات عرفای بم ، اشاره ای به این حقیقت است. اکثریت مردم امروز ساکن بم شیعه هستند.
